Μεταπηδήστε στο περιεχόμενο

Έρευνα

    Ερευνητικά Προγράμματα

    2019-2022*                «Γονιδιωματική Μελέτη του κρανιού (Argyrosomus regius) με σκοπό την χαρτογράφηση γονιδιακών τόπων ποσοτικών ιδιοτήτων και την έναρξη του πρώτου Ευρωπαϊκού προγράμματος γενετικής επιλογής (MeagreGen)» με κωδικό MIS (ΟΠΣ) 5048537 στο πρόγραμμα «ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΤΙΚΟΤΗΤΑ, ΕΠΙΧΕΙΡΗΜΑΤΙΚΟΤΗΤΑ & ΚΑΙΝΟΤΟΜΙΑ» (ΕΠΑνΕΚ), «Ειδικές Δράσεις «Υδατοκαλλιέργειες» – «Βιομηχανικά Υλικά» – «Ανοιχτή Καινοτομία στον Πολιτισμό»

    2019-2022*                «Ανάπτυξη υψηλής πυκνότητας (high density) μικροσυστοιχιών Μοναδικών Νουκλεοτιδικών Πολυμορφισμών (SNP-chip) για την τσιπούρα (Sparus aurata) και το λαβράκι (Dicentrarchus labrax). (SNPbb-chip)» με κωδικό MIS (ΟΠΣ) 5052036 στο πρόγραμμα «ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΤΙΚΟΤΗΤΑ, ΕΠΙΧΕΙΡΗΜΑΤΙΚΟΤΗΤΑ & ΚΑΙΝΟΤΟΜΙΑ» (ΕΠΑνΕΚ), «Ειδικές Δράσεις «Υδατοκαλλιέργειες» – «Βιομηχανικά Υλικά» – «Ανοιχτή Καινοτομία στον Πολιτισμό»

    2018 -2021                 «ΜΕΛΕΤΗ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΟΣ ΚΑΙ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΩΝ ΚΟΙΝΟΤΗΤΩΝ ΣΤΗΝ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΚΑΙ ΠΑΡΑΓΩΓΗ ΕΚΤΡΕΦΟΜΕΝΗΣ ΤΣΙΠΟΥΡΑΣ ΚΑΙ ΛΑΒΡΑΚΙΟΥ»με Κωδικό ΟΠΣ 5010952 στο Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «ΑΛΙΕΙΑΣ ΚΑΙ ΘΑΛΑΣΣΑΣ 2014-2020»

    2019*                        Ανάλυση γονικής προέλευσης και κατασκευή γενεαλογικού δένδρου ατόμων εκτρεφόμενου πληθυσμού τσιπούρας με τη χρήση σημαντών DNA (ακρωνύμιο: PARENTAGE 4,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./ ΔΕ από την ΑΝΔΡΟΜΕΔΑ Α.Ε.)

    2019-2020*                «Pairwise relatedness estimation individuals in brood-stock population using nuclear molecular DNA markers» (ακρωνύμιο: BroodPair2,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Π.Π. από την ILKNAK S.A.)

    7/1990 – 12/1991       A comparison of cost effectiveness of a commercial food pellet with manual, automatic and self-demand distribution for sea bass (Dicentrarchus labrax, L.) rearing (FAR (AQ31.1.280) DGXIV).

    1990 – 1993                Γενετική βελτίωση της τσιπούρας (ΣΠΑ, 14 ΙΤΗΑ 2).

    1992 – 1995                Development and use of DNA probes to (a) select genetically improved sea bream and sea bass for aquaculture and (b) assist genetic research in African catfish. (FAR AQ 3 765).            

    1997 – 1998                Χρησιμοποίηση μικροδορυφορικών σημαντών DNA για την ταυτοποίηση γεννητόρων τσιπούρας (Sparus aurata) με ανώτερα αναπαραγωγικά χαρακτηριστικά. (ΕΠΕΤ ΙΙ, Δράση ΑΞΙΑ 18).

    10/98 – 6/99               – Gilthead seabream strain identification using AFLP markers and their relative growth performance in a commercial communal rearing system (NCM grant, funded by a commercial company) – Israel Oceanographic & Limnological Research (IOLR), National Center for Mariculture (NCM), Genetics Department, Israel.

                                     – Συμμετοχή στην εκπόνηση προγράμματος γενετικής επιλογής στα πλαίσια συνεργασίας ιδιωτικής μονάδας εκτροφής ψαριών με το National Center for Mariculture (NCM).

    6/1999 – 10/1999       – Shark DNA study: Development of a molecular technique for the identification of the species to which commercially sold dried fins belong (Contract FAO).

                                     – Genetic identification of the gilthead sea bream, sea bass and turbot breeders of the farm TINAMENOR S.A. (Contract Tinamenor S.A., Spain)

    11/1999 – 4/2000       – Gilthead seabream strain identification using AFLP markers and their relative growth performance in a commercial communal rearing system (NCM grant, funded by a commercial company) – Israel Oceanographic & Limnological Research (IOLR), National Center for Mariculture (NCM), Genetics Department, Israel.

                                     – Evaluation of genetic variability of sea bass broodstocks using microsatellite markers. – Israel Oceanographic & Limnological Research (IOLR), National Center for Mariculture (NCM), Genetics Department, Israel.

    5/2000 – 1/2002         Οργάνωση του προγράμματος γενετικής βελτίωσης των ιχθυοαποθεμάτων της Νηρεύς Α.Ε.

    2001 – 2005                Tools for the genetic improvement of sea bass. Construction and preliminary application of a medium density linkage and synteny map (BASSMAP – Quality of Life, QLRT-2000-01701). Επιστημονικός Υπεύθυνος για την εταιρεία ΝΗΡΕΥΣ Α.Ε (Leader WP11).

    2001 – 2005               Bridging genomes: An integrated genomic approach toward genetic improvement of aquacultured fish species (BRIDGEMAP –  Quality of Life, QLRT-2000-01797). Επιστημονικός Υπεύθυνος για την εταιρεία ΝΗΡΕΥΣ Α.Ε. (Leader WP6)

    2004 – 2007               Combined genetic and functional genomic approaches for stress and disease resistance marker assisted selection in fish and shellfish (Acronym: AQUAFIRST – STREP 513692) Επιστημονικός Υπεύθυνος για την εταιρεία ΝΗΡΕΥΣ Α.Ε.

    2010*                        DNA fingerprinting γονέων και απογόνων και αναδρομική αναγνώριση της γονικής προέλευσης των απογόνων (ακρωνύμιο: DNA fingerprinting,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./Μ από την ΑΝΔΡΟΜΕΔΑ Α.Ε.)

    2010 – 2013*             Ανάπτυξη καινοτόμων μεθόδων και μοριακών εργαλείων για τον έλεγχο και τη βελτίωση της ποιότητας των εκτρεφόμενων πληθυσμών τσιπούρας και λαβρακιού (ακρωνύμιο:  ΜΕΠΟΙΟΤΗΤΑ – ΣΥΝΕΡΓΑΣΙΑ, 09ΣΥΝ-24-619)

    2010*                        Εθνικό Δίκτυο Ερευνών Βιοποικιλότητας (ΗELLBIONET). Γενική Γραμματεία Έρευνας και Τεχνολογίας στο πλαίσιο Δημιουργίας Εθνικών Ερευνητικών Δικτύων σε Τομείς που αφορούν τις Ερευνητικές Υποδομές του Ευρωπαϊκού Οδικού Χάρτη των Ερευνητικών Υποδομών (ESFRI-EUROPEAN STRATEGY FORUM FOR RESEARCH INFRASTRUCTURES) και ειδικότερα για την Υποδομή «Science and Technology Infrastructure for Biodiversity Data and Observatories/LIFE WATCH» (Ιανουάριος 2010).

    2011 – 2012*             Αναδρομική αναγνώριση γονέων και μελέτη της αλληλεπίδρασης γονοτύπου – περιβάλλοντος ως προς την αύξηση (ακρωνύμιο: ΓΟΝΠΕΡ,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./Μ από την ΑΝΔΡΟΜΕΔΑ Α.Ε.)

    2012 – 2014*             Εκτίμηση γενετικών παραμέτρων και ανίχνευση γενετικών τόπων ποσοτικών ιδιοτήτων (qtl) για οικονομικά σημαντικούς χαρακτήρες σε καλλιεργούμενους πληθυσμούς τσιπούρας (ακρωνύμιο: BreamQTL – ΑΡΧΙΜΗΔΗΣ ΙΙΙ – Ενίσχυση Ερευνητικών Ομάδων στο ΤΕΙ Μεσολογγίου» του ΕΠΕΔΒΜ με κωδικόMIS 383566)

    2012 – 2013*             Ανάλυση γονικής προέλευσης και κατασκευή γενεαλογικού δένδρου ατόμων εκτρεφόμενου πληθυσμού τσιπούρας με τη χρήση μικροδορυφορικών σημαντών (ακρωνύμιο: ΠΑΤΡΟΤΗΤΑ,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./Μ από την ΑΝΔΡΟΜΕΔΑ Α.Ε.)

    2013 – 2014*             Ανάλυση γονικής προέλευσης και κατασκευή γενεαλογικού δένδρου ατόμων εκτρεφόμενου πληθυσμού τσιπούρας με τη χρήση σημαντών DNA (ακρωνύμιο: PARENTAGE,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./Μ από την ΑΝΔΡΟΜΕΔΑ Α.Ε.)

    2014-2015                 Προσδιορισμός της βέλτιστης μορφολογίας της τσιπούρας, ανάπτυξη σύγχρονων μορφομετρικών εργαλείων και έλεγχος της γενετικής τους βάσης για την ενσωμάτωση του σχήματος σε προγράμματα γενετικής βελτίωσης (1455/25-7-2014 Απόφασης Ένταξης Χρηματοδότησης Πράξης, Μέτρο 3.5. του ΕΠΑΛ 2007-2013)

    2016-2017*                «Ανάπτυξη τεχνογνωσίας και προηγμένες υπηρεσίες εφαρμοσμένης έρευνας και ανάπτυξης, στον Τομέα της Εφαρμοσμένης Γενετικής από Ιδιώτες Χρηματοδότες, με την εφαρμογή μοριακών γονιδιωματικών μεθόδων για την βελτιστοποίηση προϊόντων ή διαχείρισης των εκτρεφόμενων / φυσικών πληθυσμών υδρόβιων οργανισμών», (ακρωνύμιο: ResDev,Έργο του Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./ΔΕ)

    2017*                        «Pairwise relatedness estimation individuals in brood-stock population using nuclear molecular DNA markers» (ακρωνύμιο: BroodPair,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./ΔΕ από την ILKNAK S.A.)

    2017*                        Ανάλυση γονικής προέλευσης και κατασκευή γενεαλογικού δένδρου ατόμων εκτρεφόμενου πληθυσμού τσιπούρας με τη χρήση σημαντών DNA (ακρωνύμιο: PARENTAGE 2,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./ ΔΕ από την ΑΝΔΡΟΜΕΔΑ Α.Ε.)

    2018*                        Ανάλυση γονικής προέλευσης και κατασκευή γενεαλογικού δένδρου ατόμων εκτρεφόμενου πληθυσμού τσιπούρας με τη χρήση σημαντών DNA (ακρωνύμιο: PARENTAGE 3,Ανάθεση Έργου στον Ε.Λ.Κ.Ε. του Τ.Ε.Ι./ ΔΕ από την ΑΝΔΡΟΜΕΔΑ Α.Ε.)

    • Ιστορική καταγραφή των κυριότερων αβιοτικών πραγόντων που επηρεάζονται από την κλιματική αλλαγή
      Για να δείτε το περιεχόμενο του αρχείου πιέστε [ .. ΕΔΩ .. ]
    • Κατσαργύρη, Χ. (2008). Μελέτη περιβαλλοντικών παραμέτρων στη λιμνοθάλασα της Κλείσοβας (Μεταπτυχιακή εργασία).
      Για να δείτε το περιεχόμενο του αρχείου πιέστε [ .. ΕΔΩ .. ]

    Δημοσιεύσεις

    Διατριβές

    • Μπαταργιάς Κ. (1993). Μελέτη παραγωγής διαγονιδιακών ατόμων τσιπούρας (Sparus aurata, Linneaus 1758) και της πιθανής επίδρασής τους στο φυσικό περιβάλλον. Μεταπτυχιακή Διατριβή, Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης Ηράκλειο, 93 σελ.
    • Μπαταργιάς Κ. (1999). Γενετική της τσιπούρας (Sparus aurata). Μελέτη των μικροδορυφορικών αλληλουχιών και χρήση τους στην εκτίμηση γενετικών παραμέτρων της αύξησης και άλλων ποσοτικών χαρακτήρων. Διδακτορική Διατριβή , Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης Ηράκλειο, 227 σελ.

    Δημοσιεύσεις σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά

    • Dermitzakis E., A. Clark, C. Batargias, A Magoulas, and E. Zouros (1998). Negative covariance indicates mutation bias in a two-locus microsatellite system in the fish Sparus aurata. Genetics 150: 1567-1575.
    • Batargias C., M. Dermitzakis, A. Magoulas and E. Zouros (1999). Characterization of six polymorphic microsatellite markers in gilthead seabream, Sparus aurata (Linnaeus 1758). Mol. Ecol. 8(5): 897-898.
    • Papsatis M., C. Batarias, P. TIANGOS and M. KENTOURI (1999). Feeding and growth responses of sea bass (Dicentrarchus labrax) reared by four feeding methods. Aquaculture 175: 293-305
    • Kvitt H., M. Ucko, A. Zlotkin, C. Batargias, W. Knibb, A Colorni (2002). Photobacterium damselae ssp. piscicida: Detection by direct amplification of 16S rRNA gene sequences and genotypic variation as determined by amplified fragment length polymorphism (AFLP). Dis Aquat Org 48: 187–195.
    • Kotoulas, G and the BRIDGEMAP Consortium (2006). Aspects of Comparative Genomics in the Gilthead Sea Bream, Sparus auratus. The Israeli Journal of Aquaculture – Bamidgeh, 58(4): 347-349.
    • Chatziplis D., Batargias C., Tsigenopoulos C.S., Magoulas A., Kollias S., Kotoulas G., Volckaert F.A.M., Haley C.S. (2007). Mapping quantitative trait loci in European sea bass (Dicentrarchus labrax): The BASSMAP pilot study. Aquaculture 272S1: S172–S182
    • Massault C., Hellemans B., Louro B., Batargias C., Van Houdt J., Canario A., Volckaert F., Bovenhuis H., Haley C., de Koning D. (2010). QTL for body weight, morphometric traits and stress response in European sea bass Dicentrarchus labrax. Animal Genetics, 41(4): 337-345, ISSN 0268-9146
    • Loukovitis D, Sarropoulou E, Tsigenopoulos CS, Batargias C, Magoulas A, Apostolidis AP, Chatziplis D, Kotoulas G (2011) Quantitative Trait Loci Involved in Sex Determination and Body Growth in the Gilthead Sea Bream (Sparus aurata L.) through Targeted Genome Scan. PLoS ONE 6(1): e16599. doi:10.1371/journal.pone.0016599
    • Boulton, K., Massault, C., Houston, R.D., de Koning, D.J., Haley, C.S., Bovenhuis, H., Batargias, C., Canario, A.V.M., Kotoulas, G., Tsigenopoulos, C.S. (2011) QTL affecting morphometric traits and stress response in the gilthead seabream (Sparus aurata) Aquaculture, 319 (1-2): 58-66.
    • Kiparissis S., D. Loukovitis and C. Batargias (2012). First record of the Bermuda sea chub Kyphosus saltatrix (Pisces: Kyphosidae) in Greek waters. Marine Biodiversity Records, 5, e11 doi:10.1017/S1755267211001199.
    • Volckaert F., Hellemans B., Batargias C., Louro B., Massault C., Van Houdt J., Haley C., de Koning D., Canario A. (2012). Heritability of cortisol response to confinement stress in European sea bass Dicentrarchus labrax. Genetics Selection Evolution, 44:15 doi:10.1186/1297-9686-44-15
    • Loukovitis, D., Sarropoulou, E., Batargias, C., Apostolidis, A. P., Kotoulas, G., Tsigenopoulos, C. S., & Chatziplis, D. (2012). Quantitative trait loci for body growth and sex determination in the hermaphrodite teleost fish S parus aurata L. Animal genetics, 43(6): 753-759, doi: 10.1111/j.1365-2052.2012.02346.
    • Loukovitis, D., Batargias, C., Sarropoulou, E., Apostolidis, A. P., Kotoulas, G., Magoulas, A., Tsigenopoulos, C. S., & Chatziplis, D. (2013). Quantitative trait loci affecting morphology traits in gilthead seabream (S parus aurata L.). Animal genetics, 44(4): 480-483 , doi: 10.1111/age.12027
    • Loukovitis, D., Chatziplis, D., & Batargias, C. (2016). Age-dependent QTL affecting body weight in gilthead seabream (Sparus aurata L.). Mediterranean Marine Science, 17(3), 666-669.
    • Louro, B., Kuhl, H., Tine, M., de Koning, D.J., Batargias, C., Volckaert, F.A., Reinhardt, R., Canario, A.V. and Power, D.M., (2016). Characterization and refinement of growth related quantitative trait loci in European sea bass (Dicentrarchus labrax) using a comparative approach. Aquaculture, 455:.8-21.
    • Fragkoulis, S., Christou, M., Karo, R., Ritas, C., Tzokas, C., Batargias, C. and Koumoundouros, G., (2017). Scaling of body‐shape quality in reared gilthead seabream Sparus aurata L. Consumer preference assessment, wild standard and variability in reared phenotype. Aquaculture Research, 48(5): 2402-2410.
    • Stathopoulou, P., Rafailidou, N., Tzokas, K., Batargias, C., & Tsiamis, G. (2018). Near-Complete Genome Sequence of a Fish Nervous Necrosis Virus Isolated from a Clinical Disease Outbreak in Farm-Reared Bream Sparus aurata in Spain. Genome announcements, 6(1), e01392-17.
    • Kiparissis, S., Peristeraki, P., Tampakakis, K., Kosoglou, I., Doudoumis, V., & Batargias, C. (2018). Range expansion of a restricted lessepsian: westbound expansion breakthrough of Lagocephalus spadiceus (Richardson, 1844) (Actinopterygii: Tetraodontidae).
    • Fragkoulis, S., Batargias, C., Kolios, P., & Koumoundouros, G. (2018). Genetic parameters of the upper-jaw abnormalities in Gilthead seabream Sparus aurata. Aquaculture.
    • Asimakis, E. D., Doudoumis, V., Hadapad, A. B., Hire, R. S., Batargias, C., Niu, C., Khan, M., & Tsiamis, G. (2019). Detection and characterization of bacterial endosymbionts in Southeast Asian tephritid fruit fly populations. BMC microbiology, 19(1), 1-18.
    • Cladas Y, Spala K, Doudoumis V, Ketsilis-Rinis V, Batargias C and Koutsikopoulos C, 2019. Presence Confirmation of Non-Native Species Pagrus major (Temminck and Schlegel, 1843) in the Eastern Mediterranean., 2; 9(2): 555756,
    • Papaioannou, C., Stefanakis, M. K., Batargias, C., Kilias, G., Anastasopoulos, E., Katerinopoulos, H. E., & Papasotiropoulos, V. (2020). Genetic Profiling and Volatile Oil Content of Oregano Genotypes from Greece. Revista Brasileira de Farmacognosia, 1-6.
    • Bel Mokhtar, N., Maurady, A., Britel, M. R., El Bouhssini, M., Batargias, C., Stathopoulou, P., … & Tsiamis, G. (2020). Detection of Wolbachia infections in natural and laboratory populations of the Moroccan hessian fly, Mayetiola destructor (Say). Insects, 11(6), 340.
    • Fragkoulis, S., Economou, I., Moukas, G., Koumoundouros, G., & Batargias, C. (2020). Caudal fin abnormalities in Gilthead seabream (Sparus aurata L.) have a strong genetic variance component. Journal of Fish Diseases, 43(7), 825-828.
    • Asimakis, E., Stathopoulou, P., Sapounas, A., Khaeso, K., Batargias, C., Khan, M., & Tsiamis, G. (2021). New Insights on the Zeugodacus cucurbitae (Coquillett) Bacteriome. Microorganisms, 9(3), 659.
    • Lattos, A., Bitchava, K., Giantsis, I. A., Theodorou, J. A., Batargias, C., & Michaelidis, B. (2021). The Implication of Vibrio Bacteria in the Winter Mortalities of the Critically Endangered Pinna nobilis. Microorganisms, 9(5), 922.
    • Fragkoulis, S., Kerasovitis, D., Batargias, C., & Koumoundouros, G. (2021). Body-shape trajectories and their genetic variance component in Gilthead seabream (Sparus aurata L.). Scientific reports, 11(1), 1-10.

    Κεφάλαια σε βιβλία

    • Magoulas A., G. Kotoulas, K. Batargias, and E. Zouros (1998). Genetic markers in marine biology and aquaculture research: when to use what. In: Genetic and Aquaculture in Africa, J.F. Agnese (ed.), Paris, ORSTOM, pp. 67-78.
    • Volckaert, F.A.M., C. Batargias, A. Canario, D. Chatziplis, D. Chistiakov, C. Haley, A. Libertini and C. Tsigenopoulos (2008). “European Sea Bass”. Κεφάλαιο (Chapter 5) στον τόμο “Genome Mapping and Genomics in Fishes and Aquatic Animals” (eds. T.D. Kocher and C. Kole) της σειράς “Genome Mapping and Genomics in Animals” (ed. C. Kole). Volume 2, pages: 117-133, ISBN: 978-3-540-73836-7, 2008, Springer-Verslag, New York.

    Βάσεις Δεδομένων